Fotonik alanında katma değeri yüksek yerli teknolojilerin geliştirilmesini mümkün kılacak özgün bilgi ve teknoloji üretimini teşvik etmek; ileri düzey araştırmaları ürün odaklı Ar-Ge süreçleriyle bütünleştirerek ulusal sanayinin uluslararası rekabet gücüne katkı sunmak; bu doğrultuda çağdaş teknolojileri üreten ve uygulayan nitelikli araştırmacıların yetişmesine yönelik sürdürülebilir bir ekosistem oluşturmaktır. Merkez, açık inovasyon modeliyle üniversite, sanayi ve kamu kuruluşlarını ortak bir platformda buluşturarak temel araştırmadan prototipleme ve ticarileşmeye uzanan tam entegre bir Ar-Ge zinciri kurmayı hedeflemektedir.
Fotonik biliminde bilginin ulusal ve uluslararası düzeyde öncü kaynağı olmak; bilimsel buluşlar ile teknolojik yenilikleri bütüncül bir yaklaşımla ele alarak alanında referans gösterilen bir araştırma merkezi haline gelmektir. Uluslararası rekabetçi araştırma altyapısı, nitelikli insan kaynağı ve girişimcilik ekosistemiyle fotonik tabanlı teknolojilerde bölgesel ve küresel ölçekte söz sahibi bir merkez olmak vizyonu benimsenmektedir.